Clínica Alemana de Santiago S.A. fue creada como filial de la Sociedad de Beneficencia Hospital Alemán, corporación de derecho privado sin fines de lucro fundada el 5 de julio de 1905 y refundada en el 2.000 como Corporación Chileno-Alemana de Beneficencia. En 2012, esta entidad redefinió la modalidad y estructura de administración de sus principales actividades, creando una nueva sociedad responsable del gobierno corporativo de su área de salud. Se trata de una sociedad por acciones, denominada Clínica Alemana SpA, a la que se le traspasaron la propiedad de Clínica Alemana de Santiago S.A., Clínica Alemana Temuco S.A. y Clínica Alemana de Valdivia S.A. Bajo esta estructura, Clínica Alemana cuenta actualmente con un directorio, constituido por cinco integrantes y una administración encabezada por el gerente general y el médico director.