La Empresa Portuaria San Antonio (EPSA) es una empresa autónoma del Estado, creada por ley en 1997, cuyo objeto es la administración, conservación y desarrollo de la actividad marítimo-portuaria del Puerto San Antonio. La propiedad de la empresa es 100% estatal y no participa en la propiedad de otras empresas filiales ni coligadas. Su política de financiamiento se sustenta con recursos propios. La empresa es administrada por un Directorio, compuesto por cinco miembros más un representante de los trabajadores. La ejecución de los acuerdos del Directorio la realiza el Gerente General, en el cual se han delegado las atribuciones necesarias para el cumplimiento de las mismas. Respaldan su gestión tres gerentes de área que controlan los aspectos administrativos, financieros, comerciales, operacionales y técnicos del puerto.